Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms