Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA6Q9UF33 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EPHA6Q9UF33 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EPHA6Q9UF33 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHA6Q9UF33 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHA6Q9UF33 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHA6Q9UF33 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHA6Q9UF33 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHA6Q9UF33 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHA6Q9UF33 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHA6Q9UF33 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHA6Q9UF33 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHA6Q9UF33 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms