Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM10Q9UDY6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms