Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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