Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS29Q9UBQ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS29Q9UBQ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 423.9 ms