Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms