Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATXN10Q9UBB4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN10Q9UBB4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms