Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms