Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms