Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD7Q9P2D1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms