Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHRF1Q9P1Y6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHRF1Q9P1Y6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHRF1Q9P1Y6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHRF1Q9P1Y6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHRF1Q9P1Y6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHRF1Q9P1Y6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHRF1Q9P1Y6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PHRF1Q9P1Y6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHRF1Q9P1Y6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHRF1Q9P1Y6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PHRF1Q9P1Y6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PHRF1Q9P1Y6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms