Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNKQ9P0W0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNKQ9P0W0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms