Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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