Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms