Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV7

ZIM2, Zinc finger imprinted 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM2Q9NZV7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM2Q9NZV7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms