Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNAH9Q9NYC9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAH9Q9NYC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms