Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BARHL2Q9NY43 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms