Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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