Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC38A7Q9NVC3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms