Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms