Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC3Q9NUD5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms