Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA4L2Q9NRX3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA4L2Q9NRX3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA4L2Q9NRX3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA4L2Q9NRX3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA4L2Q9NRX3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA4L2Q9NRX3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA4L2Q9NRX3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NDUFA4L2Q9NRX3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFA4L2Q9NRX3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms