Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR21

PARP11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP11Q9NR21 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARP11Q9NR21 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARP11Q9NR21 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms