Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCB9Q9NP78 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms