Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP29Q9HBJ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms