Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CATSPERBQ9H7T0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPERBQ9H7T0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms