Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00597Q9H2U6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms