Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA10Q9GZZ6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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