Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPESC1Q9GZL8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPESC1Q9GZL8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms