Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF2Q9BZW4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms