Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6BQ9BYG5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARD6BQ9BYG5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms