Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PECRQ9BY49 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PECRQ9BY49 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms