Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC46A2Q9BY10 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms