Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF4Q9BXJ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms