Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR4Q9BXB1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms