Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KATNB1Q9BVA0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KATNB1Q9BVA0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms