Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD3Q9BV44 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms