Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCMBPQ9BTE3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCMBPQ9BTE3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms