Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms