Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms