Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF559Q9BR84 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF559Q9BR84 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms