Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms