Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF15Q99988 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms