Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRX2Q99811 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms