Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5SQ99766 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5SQ99766 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms