Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEIS3Q99687 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEIS3Q99687 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms