Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POP1Q99575 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POP1Q99575 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP1Q99575 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP1Q99575 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP1Q99575 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP1Q99575 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP1Q99575 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP1Q99575 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP1Q99575 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP1Q99575 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP1Q99575 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP1Q99575 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP1Q99575 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POP1Q99575 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POP1Q99575 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POP1Q99575 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POP1Q99575 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POP1Q99575 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POP1Q99575 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POP1Q99575 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POP1Q99575 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POP1Q99575 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POP1Q99575 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POP1Q99575 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
POP1Q99575 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POP1Q99575 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POP1Q99575 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POP1Q99575 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POP1Q99575 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP1Q99575 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP1Q99575 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP1Q99575 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP1Q99575 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
POP1Q99575 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
POP1Q99575 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP1Q99575 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP1Q99575 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP1Q99575 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP1Q99575 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP1Q99575 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP1Q99575 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP1Q99575 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POP1Q99575 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POP1Q99575 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POP1Q99575 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POP1Q99575 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POP1Q99575 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POP1Q99575 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POP1Q99575 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POP1Q99575 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POP1Q99575 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP1Q99575 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP1Q99575 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP1Q99575 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP1Q99575 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP1Q99575 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP1Q99575 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP1Q99575 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP1Q99575 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP1Q99575 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POP1Q99575 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POP1Q99575 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POP1Q99575 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POP1Q99575 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POP1Q99575 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POP1Q99575 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POP1Q99575 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POP1Q99575 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POP1Q99575 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POP1Q99575 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POP1Q99575 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POP1Q99575 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POP1Q99575 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POP1Q99575 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POP1Q99575 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POP1Q99575 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POP1Q99575 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POP1Q99575 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POP1Q99575 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP1Q99575 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POP1Q99575 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POP1Q99575 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POP1Q99575 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POP1Q99575 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms