Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP19Q99542 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms