Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NAP1L3Q99457 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms