Protein–RNA interactions for Protein: Q99442

SEC62, Translocation protein SEC62, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC62Q99442 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC62Q99442 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SEC62Q99442 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC62Q99442 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms